Как известно, эффект торможения в любой технике достигается при помощи трения, которое  возникает между колодками и внутренней поверхностью  барабана, связанной со ступицей самого колеса. При торможении колеса, накладки и барабан разогреваются, что приводит в свою очередь к снижению эффективности торможения. Для более эффективного отвода тепла ступицы на колесах мотоциклов "ИЖ" сделаны из алюминиевого сплава.
 На мотоциклах ИЖП5-01, ИЖП6 немного изменена конструкция самого рычага в приводе тормоза заднего колеса. Он выполнен из трубы и расположился  под подножкой пассажира, что конечно  улучшает эргономику торможения. Ось соединяющая кронштейн рычага с тягой почти совпадает с осью маятниковой вилки на задней подвески. Это предотвращает качание рычага тормоза  когда срабатывает задняя подвеска, т.е. рычаги переходного тормозного валика.
Принцип работы переднего тормоза аналогичен описанному выше, разница лишь в приводе (передний тормоз приводится в действие тросовым приводом от рычага ручного тормоза, расположенного на правой стороне руля) и в наличии двух кулачков, действующих одновременно на разные концы тормозных колодок. При нажатии на рычаг кулачки поворачиваются и раздвигают тормозные колодки, прижимая их к тормозному барабану,  который жестко связан со ступицей колеса. Между колодками и барабаном  возникают силы трения, значительно увеличивают сопротивление качению колеса и мотоцикл снижает скорость и останавливается. Тормозная система требует особого внимания.

Необходимо следить, чтобы тормозные колодки не касались барабана. Узнать степень износа тормозных накладок можно при помощи положения флажка индикатора износа. Допустимый износ соответствует совпадению флажка с меткой №1 на крышке барабана при выжатом тормозе переднего колеса. Когда собирайте, флажок установите на метку ноль. После того как тормоз отрегулируется флажок должен занять положение между двумя метками 0 и 1.
Неисправности в тормозной системе, обычно, возникают из - за попадания масла на  накладки или их износа. При замасливании накладок поверхность необходимо промыть бензином, или средством, которое полностью удаляет масляный налет. Если тормозные колодки ну уж  сильно сглажены, их нужно зачистить наждачкой и снова промыть. После полной сборки колес и тщательной регулировки тормозной системы необходимо опробовать надежность и отлаженность работы тормозов.